Fel cemegyn, mae angen sylw arbennig ar ddiheintyddion yn eu lleoliad storio. Yn gyffredinol, dylid storio diheintyddion mewn lle sych, wedi'i awyru'n dda, i ffwrdd o olau haul uniongyrchol a mynediad plant, fel lle oer, sych fel ystafell storio, cabinet neu flwch. Ar ben hynny, dylid eu cadw i ffwrdd o fwyd a diodydd i atal llyncu neu gamddefnyddio damweiniol. Os yw'r diheintydd yn hylif, dylid ei storio mewn cynhwysydd wedi'i selio i atal gollyngiadau. Wrth storio, dylid ei gadw ar wahân i gemegau eraill er mwyn osgoi damweiniau.
